Mikromacierze i odczynniki

Mikromacierze DNA stanowią centralną część zintegrowanej platformy naukowej zaprojektowanej tak by zapewnić wszechstronne narzędzia które umożliwiają prowadzenie poszukiwań w sposób definiowany przez użytkownika, dzięki zastosowaniu 60-merowych sond oligonukleotydowych syntetyzowanych in-situ Zapewniają one nadzwyczajną czułość i powtarzalność, jak również sześciokrotnie wyższy stosunek sygnału do szumu niż macierze innych producentów.

Drukowanie przez Agilent mikromacierzy z projektów klienta pozwala naukowcom na maksymalną kontrolę projektu badawczego i ograniczenie jego kosztu. Stwórz swoją własną mikromacierz używając eArray – internetowego narzędzia do tworzenia macierzy. Uzyskasz bezpośredni łatwy dostęp do formatów wielokrotnych, gotowych i walidowanych sekwencji sond oraz narzędzi do samodzielnego tworzenia sekwencji sond.

Ekspresja genów

Wykorzystanie mikromacierzy w badaniu ekspresji genów jest obecnie standardową metodą stosowaną na całym świecie. Mikromacierze Agilent umożliwiają otrzymanie najczulszych wyników. Jednocześnie możliwość tworzenia własnych projektów mikromacierzy umożliwia najlepsze dopasowanie macierzy dla każdego eksperymentu. Opatentowana przez Agilent metoda tworzenia mikromacierzy wykorzystuje unikatowe rozwiązania umożliwiające otrzymanie dłuższych sond o najwyższej jakości. Dzięki pewności sekwencji każdej z sond użytkownik uzyskuje wysoką czułość przeprowadzanego eksperymentu.

• Technologia produkcji mikromacierzy Agilent SurePrint Inkjet zapewnia pełną kontrolę nad zawartością mikromacierzy. Użytkownik może tworzyć własne lub dowolnie zmieniać już istniejące projekty macierzy zachowując tą samą cenę i wysoką jakość wyniku.
• Wysoka czułość mikromacierzy Agilent możliwa jest dzięki zastosowaniu 60-merowych sond oligonukleotydowych. Taka konstrukcja sond umożliwia pracę ze złożonymi próbkami i wykrywanie zmian biologicznych na poziomie niedostępnym dla innych technik.
• Możliwość badania do 8 prób na jednym slajdzie umożliwia przeprowadzanie eksperymentów na różną skalę oraz obniżenie kosztów eksperymentu.

Nowość: Wprowadzamy nowy Zestaw do znakowania Quick Amp wykorzystujący małe ilości RNA przeznaczony do znakowania od 25 ng eukariotycznego RNA.

Wprowadzamy nowy Zestaw do znakowania Quick Amp wykorzystujący małe ilości RNA przeznaczony do znakowania od 25 ng eukariotycznego RNA.

Kalkulator do obliczenia ilości odczynników niezbędnych do wykonania zaplanowanej liczby mikromacierzy (należy wpisać ilość planowanych macierzy, nie zaś slajdów!)

CGH

Tradycyjne metody CGH (ang. Comparative Genomic Hybridization) umożliwiły szybką analizę zmian chromosomowych. Niestety do tej pory były one mało dokładne i można je było stosować dla małej ilości próbek. W celu uzyskania wszystkich możliwości jakie daje CGH naukowcy potrzebują platformy, która zapewni:

• wysoką rozdzielczość by dokładnie zlokalizować zmiany w genomie;
• skanowanie całego genomu z jednoczesną możliwością skupienia się na jego konkretnych obszarach.

Mikromacierze CGH firmy Agilent łączą te cechy i umożliwiają badanie m.in. aberracji chromosomowych oraz powtórzonych kopii genów z pewnością, której potrzebujesz.

• Technologia produkcji mikromacierzy Agilent SurePrint Inkjet zapewnia pełną kontrolę nad zawartością mikromacierzy. Użytkownik może tworzyć własne lub dowolnie zmieniać już istniejące projekty macierzy zachowując tą samą cenę i wysoką jakość wyniku.
• Wysoka czułość mikromacierzy Agilent możliwa jest dzięki zastosowaniu 60-merowych sond oligonukleotydowych. Taka konstrukcja sond umożliwia pracę ze złożonymi próbkami i wykrywanie zmian biologicznych na poziomie niedostępnym dla innych technik.
• Kompletne oprogramowanie do analizy, porównywania i wizualizacji wyników CGH oraz innych aplikacji jak np. badanie ekspresji genów czy profilu microRNA.

Kalkulator do obliczenia ilości odczynników niezbędnych do wykonania zaplanowanej liczby mikromacierzy (należy wpisać ilość planowanych macierzy, nie zaś slajdów!)

CNV

Zrozumieć zróżnicowanie struktury genomu.

Dzięki zróżnicowaniu genetycznemu każdy z nas jest niepowtarzalny oraz w różnym stopniu podatny na różnego rodzaju choroby. Przez ostatnie lata skupiono się głównie na roli SNP (polimorfizmów pojedynczych nukleotydów) w rozwijaniu się choroby. Niestety takie podejście okazało się niewystarczające. Zmienna ilość kopii genów (CNV) zmienia nasz sposób rozumienia genetycznych podstaw coraz większej liczby chorób. Dzięki wykorzystaniu metod aCGH możemy łatwo i szybko poznać rodzaj i ilość CNV w wielu loci. Mikromacierze CNV pozwalają na przeszukiwanie genomu na płaszczyźnie ponad SNP umożliwiając nowe i lepsze zrozumienie wpływu zróżnicowania genomu.

Dowiedz się więcej o CNV w kompendium Nature Genetics

miRNA

Odkryj nowe szlaki regulacji ekspresji genów. Zidentyfikuj zmiany w profilu ekspresji miRNA w sposób pewny i jednoznaczny.

MikroRNA (miRNA) należą do krótkich jednoniciowych niekodujących RNA o długości od 19 do 30 nukleotydów. W komórkach funkcja miRNA sprowadza się do szeroko rozpowszechnionego wyciszania genów. Taki mechanizm ma znaczenie w wielu ważnych procesach komórkowych takich jak: rozwój, proliferacja, różnicowanie i apoptoza. Rozpocznij swoje badania od dokładnego określenia stężenia frakcji miRNA zarówno w totalnym RNA oraz we wzbogaconych w małe RNA próbkach przy użyciu zestawu do badania małych RNA na Bioanalizatorze 2100. Odpowiedź na pytania dotyczące ekspresji miRNA uzyskasz dzięki zastosowaniu specyficznych dla miRNA mikromacierzy Agilent. Główne cechy tego rozwiązania to:

• mała ilość początkowa próby – Innowacyjny sposób projektowania sond oraz bezpośrednie znakowanie materiału wymaga tylko 100ng totalnego RNA;
• szeroki zakres – rozwiązanie Agilent do badania profilu miRNA umożliwia analizę 5 rzędów wielkości stężenia miRNA;

• dokładne rozróżnienie miRNA – synteza sond bezpośrednio na slajdzie (in situ ) umożliwia wychwycenie różnic pojedynczych nukleotydów pomiędzy cząsteczkami o podobnej długości i sekwencji.

Kalkulator do obliczenia ilości odczynników niezbędnych do wykonania zaplanowanej liczby mikromacierzy (należy wpisać ilość planowanych macierzy, nie zaś slajdów!)

Metylacje DNA

Odkryj ważne wzory metylacji DNA.

Rozwiązanie Agilent umożliwia skanowanie rozmieszczonych w całym genomie wysp CpG i sekwencji promotorowych w celu odkrycia i określenia stopnia metylacji.

Metylacja DNA jest dziedziczną modyfikacją genomu regulującą ekspresję genów bez zmiany sekwencji DNA. Ten epigenetyczny mechanizm bierze udział w regulowaniu wielu różnorodnych procesów biologicznych, a zaburzenia wzoru metylacji mogą być odpowiedzialne za niektóre schorzenia, w tym nowotworzenie. Mikromacierze do badania metylacji ułatwiają globalne poszukiwanie mechanizmów regulacyjnych In vivo. Jednocześnie nie ma ograniczeń związanych z ukierunkowaniem na konkretne geny, a cała procedura jest o wiele prostsza od dotychczas stosowanej chromatografii. Możliwość tworzenia własnych projektów mikromacierzy przez użytkowników ukierunkowuje badania na konkretne obszary zainteresowania i zwiększa rozdzielczość poszukiwania. Dzięki unikatowym rozwiązaniom Agilent do badania metylacji masz możliwość wykrywania najbardziej znaczących wydarzeń epigenetycznych.

Chip-on-Chip

Poznaj nowe zależności regulacji genów poprzez reakcje DNA-białko. Sprawnie zidentyfikuj i scharakteryzuj kompleksy regulatorowe , pojedyncze zdarzenia jak i ich sieci. Uzyskaj wiarygodne wyniki z pomocą oprogramowania ChIP Analytics.

Tradycyjne techniki analizy ekspresji genów dostarczyły wartościowych danych dotyczących ludzkiego genomu, jednak związane z nimi ograniczenia nie pozwalają na scharakteryzowanie procesu transkrypcji i regulacji genów. Charakteryzując zawiłości regulacji transkrypcyjnej wymagane są narzędzia analityczne które połączą w całość dziedziny genetyki i proteomiki. Celem przeniesienia poza tradycyjne metody ekspresyjne, rozszerzając stosowane techniki analityczne o globalną regulację genów, potrzebujesz bardzo precyzyjnej mikromacierzowej techniki, która pozwoli na badanie przypadków transkrypcyjnych. Potrzebujesz platformy za pomocą której możliwym stanie się określenie, aż do konkretnej sekwencji DNA, miejsca gdzie wiązane są regulatorowe białka, powodując aktywacje lub represję powiązanych genów. Mikromacierze ChIP-on-chip Agilent łączą obszerne pokrycie i wysoką czułość, pozwalając na mapowanie aktywności transkrypcyjnej z wysoką rozdzielczością.

• Kontrola jakości materiału genetycznego
• Hybrydyzacja i płukanie mikromacierzy
• Prezentacja Hybrydyzacja
• Skanowanie mikromacierzy
• Analiza wyników